12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2354 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2354  Gas vesicle G  100 
 
 		 82 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2336  hypothetical protein  45.59 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2383  hypothetical protein  45.59 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.406981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2377  hypothetical protein  45.59 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3577  putative gas vesicle synthesis protein  40.26 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3261  putative gas vesicle synthesis protein  40.26 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.318367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1490  gas vesicle G  40 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3027  Gas vesicle G  38.89 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2831  gas vesicle G  39.34 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3384  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0597607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0069  hypothetical protein  36.67 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.5251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1806  Gas vesicle G  33.33 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.801031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>