14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1490 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1490  gas vesicle G  100 
 
 		 81 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2831  gas vesicle G  52.05 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0069  hypothetical protein  41.33 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.5251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1259  gas vesicle protein G  45.95 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1806  Gas vesicle G  44.44 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.801031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3027  Gas vesicle G  44.16 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2354  Gas vesicle G  40 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0336  gas-vesicle operon protein gvpG1  47.37 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3577  putative gas vesicle synthesis protein  35.62 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3261  putative gas vesicle synthesis protein  35.62 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.318367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2400  hypothetical protein  41.38 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.974171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0333  hypothetical protein  45.1 
 
 		 83 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0701  hypothetical protein  44.64 
 
 		 64 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0072  gas vesicle G  41.82 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>