10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2831 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2831  gas vesicle G  100 
 
 
79 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1806  Gas vesicle G  46.75 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.801031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3027  Gas vesicle G  45.45 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1490  gas vesicle G  52.05 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0701  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1259  gas vesicle protein G  37.84 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0069  hypothetical protein  31.08 
 
 
82 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.5251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2400  hypothetical protein  49.06 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.974171  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2354  Gas vesicle G  39.34 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0072  gas vesicle G  28.26 
 
 
125 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>