44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1154 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1154  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.859238 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1576  hypothetical protein  73.53 
 
 
72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2097  hypothetical protein  72.46 
 
 
71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4005  hypothetical protein  72.73 
 
 
69 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0147  hypothetical protein  72.73 
 
 
69 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3714  hypothetical protein  63.01 
 
 
75 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0016  hypothetical protein  65.71 
 
 
71 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.987189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15830  hypothetical protein  66.15 
 
 
75 aa  97.1  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0034  hypothetical protein  64.29 
 
 
71 aa  95.9  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4336  hypothetical protein  59.15 
 
 
75 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233868  hitchhiker  0.00606572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4925  hypothetical protein  61.97 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3238  hypothetical protein  61.97 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5382  hypothetical protein  60.56 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0457246  normal  0.283066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0794  hypothetical protein  57.75 
 
 
75 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4853  hypothetical protein  57.75 
 
 
75 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0369335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22220  hypothetical protein  67.19 
 
 
69 aa  90.9  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3462  hypothetical protein  58.9 
 
 
77 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4904  hypothetical protein  58.9 
 
 
77 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534434  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1155  hypothetical protein  60.29 
 
 
69 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1524  hypothetical protein  57.35 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.391842  normal  0.307172 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1845  hypothetical protein  57.35 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.511037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4655  hypothetical protein  54.55 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4295  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409006  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3041  hypothetical protein  56.67 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1798  hypothetical protein  53.12 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4825  hypothetical protein  40.28 
 
 
72 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09150  hypothetical protein  44.93 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1710  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000468688  normal  0.0471565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2392  hypothetical protein  36.23 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157415  hitchhiker  0.00344297 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3968  hypothetical protein  41.18 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3230  hypothetical protein  41.18 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3960  hypothetical protein  42.42 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0687769  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3236  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3614  hypothetical protein  46.67 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4449  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2514  hypothetical protein  42.42 
 
 
70 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.939706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2559  hypothetical protein  42.42 
 
 
70 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.751407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2551  hypothetical protein  42.42 
 
 
70 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.093398  normal  0.620355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2422  hypothetical protein  38.57 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1279  hypothetical protein  38.57 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298117  normal  0.10145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0136  hypothetical protein  34.33 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0242144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2149  hypothetical protein  33.33 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3272  hypothetical protein  36.23 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1031  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>