43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3462 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3462  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4904  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534434  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5382  hypothetical protein  97.4 
 
 		 75 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0457246  normal  0.283066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0794  hypothetical protein  93.51 
 
 		 75 aa  146  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4336  hypothetical protein  92.21 
 
 		 75 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233868  hitchhiker  0.00606572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4853  hypothetical protein  90.91 
 
 		 75 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0369335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4925  hypothetical protein  88 
 
 		 75 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3238  hypothetical protein  88 
 
 		 75 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3714  hypothetical protein  85.71 
 
 		 75 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2097  hypothetical protein  74.65 
 
 		 71 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1576  hypothetical protein  67.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4005  hypothetical protein  69.57 
 
 		 69 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0147  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15830  hypothetical protein  64.18 
 
 		 75 aa  92  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1154  hypothetical protein  58.9 
 
 		 73 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.859238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0016  hypothetical protein  56.94 
 
 		 71 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.987189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0034  hypothetical protein  55.56 
 
 		 71 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1845  hypothetical protein  57.97 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.511037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1524  hypothetical protein  57.97 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.391842  normal  0.307172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22220  hypothetical protein  60.61 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1155  hypothetical protein  53.52 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3960  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0687769  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3041  hypothetical protein  44.26 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4825  hypothetical protein  42.25 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3236  hypothetical protein  40.62 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915065  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3968  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3230  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09150  hypothetical protein  36.62 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2422  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4295  hypothetical protein  39.68 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409006  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0242144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2392  hypothetical protein  30.99 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157415  hitchhiker  0.00344297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4655  hypothetical protein  38.24 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3614  hypothetical protein  39.06 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3272  hypothetical protein  33.8 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2149  hypothetical protein  29.58 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1798  hypothetical protein  39.06 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1031  hypothetical protein  31.08 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2514  hypothetical protein  30.3 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.939706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2551  hypothetical protein  30.3 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.093398  normal  0.620355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2559  hypothetical protein  30.3 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.751407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1279  hypothetical protein  32.39 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298117  normal  0.10145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>