41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1524 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1845  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.511037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.391842  normal  0.307172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0147  hypothetical protein  66.15 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2097  hypothetical protein  67.69 
 
 		 71 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4005  hypothetical protein  63.24 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0016  hypothetical protein  68.18 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.987189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0034  hypothetical protein  66.67 
 
 		 71 aa  90.5  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3714  hypothetical protein  55.71 
 
 		 75 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4853  hypothetical protein  61.19 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0369335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1576  hypothetical protein  60 
 
 		 72 aa  86.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4336  hypothetical protein  59.7 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233868  hitchhiker  0.00606572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4925  hypothetical protein  58.21 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3238  hypothetical protein  58.21 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5382  hypothetical protein  59.7 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0457246  normal  0.283066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0794  hypothetical protein  61.29 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1154  hypothetical protein  57.35 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.859238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3462  hypothetical protein  57.97 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4904  hypothetical protein  57.97 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534434  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15830  hypothetical protein  53.62 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239859  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22220  hypothetical protein  56.92 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1155  hypothetical protein  50.77 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3960  hypothetical protein  42.42 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0687769  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3041  hypothetical protein  40.32 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4295  hypothetical protein  40.32 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409006  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09150  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3230  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3968  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2392  hypothetical protein  34.43 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157415  hitchhiker  0.00344297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2422  hypothetical protein  36.51 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4655  hypothetical protein  42.37 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3236  hypothetical protein  38.98 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1710  hypothetical protein  37.88 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000468688  normal  0.0471565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0136  hypothetical protein  35.38 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0242144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1798  hypothetical protein  41.27 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1279  hypothetical protein  40.68 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.298117  normal  0.10145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3272  hypothetical protein  35.82 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2149  hypothetical protein  35 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2559  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.751407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2551  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.093398  normal  0.620355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2514  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.939706  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3614  hypothetical protein  33.9 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>