19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5380 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5380  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  273  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7033  hypothetical protein  70.45 
 
 
134 aa  191  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39330  hypothetical protein  60.77 
 
 
134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.680762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5373  hypothetical protein  59.4 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0559752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5462  hypothetical protein  59.4 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0140337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5749  hypothetical protein  59.4 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6037  hypothetical protein  58.09 
 
 
144 aa  164  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0870  hypothetical protein  58.14 
 
 
137 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4746  hypothetical protein  59.06 
 
 
129 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10048  hypothetical protein  59.17 
 
 
137 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329564  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4193  hypothetical protein  56.92 
 
 
132 aa  153  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5079  hypothetical protein  51.18 
 
 
151 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498009  hitchhiker  0.0000432402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4561  hypothetical protein  52.85 
 
 
151 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.453819  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5072  hypothetical protein  56.52 
 
 
132 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.547108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5919  hypothetical protein  51.75 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4527  hypothetical protein  48.84 
 
 
135 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724105  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7316  hypothetical protein  47.69 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2136  hypothetical protein  52.07 
 
 
135 aa  125  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.926167  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0039  hypothetical protein  32.79 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.855389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>