19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4527 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4527  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7316  hypothetical protein  86.57 
 
 		 135 aa  242  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39330  hypothetical protein  54.55 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.680762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7033  hypothetical protein  52.99 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2136  hypothetical protein  52.76 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.926167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6037  hypothetical protein  52.94 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5079  hypothetical protein  53.04 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498009  hitchhiker  0.0000432402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4561  hypothetical protein  53.91 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.453819  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5373  hypothetical protein  50.42 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0559752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5749  hypothetical protein  50.42 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5462  hypothetical protein  50.42 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0870  hypothetical protein  48.41 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5380  hypothetical protein  48.84 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10048  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4746  hypothetical protein  49.57 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5072  hypothetical protein  50.41 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.547108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4193  hypothetical protein  48.41 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5919  hypothetical protein  46.55 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0039  hypothetical protein  37.84 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.855389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>