19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5072 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5072  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.547108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7033  hypothetical protein  63.08 
 
 
134 aa  161  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5373  hypothetical protein  56.72 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0559752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5462  hypothetical protein  56.72 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0140337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5749  hypothetical protein  56.72 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0870  hypothetical protein  56.2 
 
 
137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6037  hypothetical protein  56.2 
 
 
144 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10048  hypothetical protein  59.5 
 
 
137 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329564  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4193  hypothetical protein  56.91 
 
 
132 aa  154  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4746  hypothetical protein  55.65 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5919  hypothetical protein  55 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5380  hypothetical protein  55.28 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2136  hypothetical protein  53.73 
 
 
135 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.926167  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39330  hypothetical protein  54.7 
 
 
134 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.680762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7316  hypothetical protein  52.42 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5079  hypothetical protein  53.15 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498009  hitchhiker  0.0000432402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4527  hypothetical protein  50.77 
 
 
135 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724105  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4561  hypothetical protein  51.35 
 
 
151 aa  123  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.453819  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0039  hypothetical protein  32.69 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.855389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>