72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3798 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7217  lysyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 567 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0790  lysyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 548 aa  740    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677714  hitchhiker  0.00421967 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1360  lysyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 553 aa  727    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0741  lysyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 551 aa  668    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3971  lysyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 551 aa  667    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0017  lysyl-tRNA synthetase  65.64 
 
 		 553 aa  748    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0432  lysyl-tRNA synthetase  61.23 
 
 		 539 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2384  lysyl-tRNA synthetase  65.73 
 
 		 565 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0201  lysyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 		 543 aa  724    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1000  lysyl-tRNA synthetase  63.07 
 
 		 545 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771898  normal  0.632109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2980  lysyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 		 582 aa  687    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0730  lysyl-tRNA synthetase  65.61 
 
 		 546 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1625  lysyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 568 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279844  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1065  lysyl-tRNA synthetase  73.3 
 
 		 567 aa  866    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.115893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0888  lysyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 545 aa  720    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0503  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 550 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6283  lysyl-tRNA synthetase  64.88 
 
 		 567 aa  733    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3162  lysyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 567 aa  690    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0151  lysyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 543 aa  717    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5166  lysyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 545 aa  714    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0790  lysyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 551 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3798  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 585 aa  1191    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3206  lysyl-tRNA synthetase  61.39 
 
 		 567 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0137  lysyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 		 552 aa  625  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1321  lysyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 530 aa  602  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1576  lysyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 530 aa  602  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.286152  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0487  lysyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 526 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.481224  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2237  lysyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 526 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2206  lysyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 552 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.485423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0584  lysyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 526 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0707  lysyl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 519 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0268  lysyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 540 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0782951  normal  0.684652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3566  lysyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 583 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279975  normal  0.84851 
 
 
-
 
NC_002978  WD0860  lysyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2261  lysyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 547 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0509  lysyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3617  lysyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.983213  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2360  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 534 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0413  lysyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.738039  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0626  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 511 aa  520  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0463  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0614307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0773  lysyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0578  lysyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 529 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0679  lysyl-tRNA synthetase  24.05 
 
 		 521 aa  140  7.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2757  lysyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 517 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000778634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2387  lysyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 567 aa  136  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.353183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2567  lysyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2651  lysyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0307953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2375  lysine--tRNA ligase (lysyl-tRNA synthetase)  24.68 
 
 		 517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2340  lysine--tRNA ligase, class I (lysyl-tRNA synthetase, class I)  25.36 
 
 		 517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2815  lysyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000378185  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1509  lysyl-tRNA synthetase  26.51 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1974  lysyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 546 aa  124  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1507  lysyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 537 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1293  lysyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 600 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3478  lysyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0116  lysyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1865  lysyl-tRNA synthetase  23.44 
 
 		 528 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0275  lysyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2553  lysyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.584812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2180  lysyl-tRNA synthetase  23.74 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.02262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1355  lysyl-tRNA synthetase  23.46 
 
 		 533 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0563  lysyl-tRNA synthetase  22.96 
 
 		 533 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4154  lysyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 527 aa  94.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0922  lysyl-tRNA synthetase  22.33 
 
 		 524 aa  92.8  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1618  lysine--tRNA ligase  26.53 
 
 		 641 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0629  lysyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 533 aa  89.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0215  lysyl-tRNA synthetase  21.06 
 
 		 545 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273119  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0773  lysyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0786  lysyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.930737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0571  lysyl-tRNA synthetase  24.87 
 
 		 598 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2009  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1154 aa  43.9  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404809  normal  0.0304235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>