72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7217 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7217  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 567 aa  1150    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1360  lysyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 553 aa  635    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0790  lysyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 548 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677714  hitchhiker  0.00421967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0432  lysyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 539 aa  647    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0017  lysyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 		 553 aa  716    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2384  lysyl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 565 aa  721    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0201  lysyl-tRNA synthetase  65.61 
 
 		 543 aa  724    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1000  lysyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 545 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771898  normal  0.632109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2980  lysyl-tRNA synthetase  82.01 
 
 		 582 aa  946    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0730  lysyl-tRNA synthetase  65.85 
 
 		 546 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0137  lysyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 552 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1625  lysyl-tRNA synthetase  82.55 
 
 		 568 aa  933    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279844  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6283  lysyl-tRNA synthetase  92.59 
 
 		 567 aa  1071    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0888  lysyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 545 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3206  lysyl-tRNA synthetase  82.19 
 
 		 567 aa  945    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3798  lysyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 585 aa  735    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5166  lysyl-tRNA synthetase  65.29 
 
 		 545 aa  718    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0151  lysyl-tRNA synthetase  65.42 
 
 		 543 aa  718    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3162  lysyl-tRNA synthetase  82.16 
 
 		 567 aa  945    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1065  lysyl-tRNA synthetase  68.14 
 
 		 567 aa  789    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.115893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0503  lysyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 		 550 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2237  lysyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 		 526 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0584  lysyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 		 526 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135058  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3971  lysyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 551 aa  618  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0487  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 526 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.481224  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0741  lysyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0790  lysyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1321  lysyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 530 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1576  lysyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 530 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.286152  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0268  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0782951  normal  0.684652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2206  lysyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 552 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.485423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0707  lysyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 519 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2261  lysyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 547 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0860  lysyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 511 aa  579  1e-164  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3617  lysyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 548 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.983213  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3566  lysyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 583 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279975  normal  0.84851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0509  lysyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0463  lysyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 533 aa  552  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0614307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2360  lysyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 534 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0626  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 511 aa  518  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0773  lysyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0413  lysyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.738039  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0578  lysyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1974  lysyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 546 aa  150  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3478  lysyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 553 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2387  lysyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 567 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.353183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1509  lysyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 		 568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2757  lysyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 		 517 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000778634 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1293  lysyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2815  lysyl-tRNA synthetase  25.28 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000378185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2651  lysyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 		 517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0307953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2375  lysine--tRNA ligase (lysyl-tRNA synthetase)  23.24 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2567  lysyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1507  lysyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2340  lysine--tRNA ligase, class I (lysyl-tRNA synthetase, class I)  24.19 
 
 		 517 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0679  lysyl-tRNA synthetase  21.92 
 
 		 521 aa  120  7e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1355  lysyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 533 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0563  lysyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 		 533 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0275  lysyl-tRNA synthetase  24.72 
 
 		 533 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0922  lysyl-tRNA synthetase  23.35 
 
 		 524 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2553  lysyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 		 528 aa  99.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.584812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0116  lysyl-tRNA synthetase  23.78 
 
 		 505 aa  99.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0629  lysyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 533 aa  97.8  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0215  lysyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 545 aa  94.4  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2180  lysyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.02262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1618  lysine--tRNA ligase  28.28 
 
 		 641 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4154  lysyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 		 527 aa  89.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1865  lysyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 528 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0773  lysyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0571  lysyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 598 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26496  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0786  lysyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 537 aa  67  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.930737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0673  glutamate--tRNA ligase  40.82 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.930403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>