15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_BR0024 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_BR0024  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.811183  normal  0.137661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0040  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0924427  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0042  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0018  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.340441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0022  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>