16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2678 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2678  V-type ATP synthase subunit F  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00920424  normal  0.0521387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2346  V-type ATP synthase subunit F  79 
 
 		 100 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.218071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0286  V-type ATP synthase subunit F  75 
 
 		 100 aa  155  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1221  V-type ATP synthase subunit F  69 
 
 		 100 aa  147  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00088216  normal  0.205349 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1182  V-type ATP synthase subunit F  70 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286084  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1610  V-type ATP synthase subunit F  65 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1242  V-type ATP synthase subunit F  56 
 
 		 99 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0387  V-type ATP synthase subunit F  54 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3352  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  47.52 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1372  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  43.56 
 
 		 115 aa  85.9  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1436  V-type ATP synthase subunit F  43.14 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1280  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  42.16 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0280  V-type ATP synthase subunit F  39.81 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.231884 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1263  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  26.85 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1771  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  25.97 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0366  V-type ATP synthase subunit F  25.96 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.497366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>