18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0286 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0286  V-type ATP synthase subunit F  100 
 
 		 100 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2346  V-type ATP synthase subunit F  81 
 
 		 100 aa  165  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.218071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1182  V-type ATP synthase subunit F  76 
 
 		 100 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286084  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2678  V-type ATP synthase subunit F  75 
 
 		 100 aa  155  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00920424  normal  0.0521387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1221  V-type ATP synthase subunit F  67 
 
 		 100 aa  147  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00088216  normal  0.205349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1610  V-type ATP synthase subunit F  56 
 
 		 99 aa  120  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1242  V-type ATP synthase subunit F  53 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0387  V-type ATP synthase subunit F  49 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1372  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  44.55 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3352  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  47.06 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1280  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  40.2 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1436  V-type ATP synthase subunit F  38.83 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0280  V-type ATP synthase subunit F  40.38 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.231884 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1263  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  29.63 
 
 		 105 aa  48.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1771  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  28.99 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0366  V-type ATP synthase subunit F  28.85 
 
 		 99 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.497366  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0064  V-type ATP synthase subunit F  27.18 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1080  vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  31 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>