29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0658 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0658  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 316 aa  630  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.714957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2981  hypothetical protein  36.15 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 818 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 799 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  28.74 
 
 		 741 aa  49.7  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  33.33 
 
 		 742 aa  49.3  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  23.04 
 
 		 753 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 740 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  23.03 
 
 		 732 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  34.53 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  23.91 
 
 		 789 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  21.71 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  25.76 
 
 		 755 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  21.71 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  27.5 
 
 		 797 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  21.71 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  21.71 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  21.71 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  21.71 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  21.81 
 
 		 750 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  31.96 
 
 		 786 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  26.26 
 
 		 761 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  27.27 
 
 		 841 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  34.17 
 
 		 821 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  25.41 
 
 		 750 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  34.57 
 
 		 718 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0659  heavy metal-binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 65 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  23.98 
 
 		 839 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  26.23 
 
 		 766 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>