17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7956 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7956    100 
 
 
532 bp  1055    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7818    87.5 
 
 
559 bp  272  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8396    86.69 
 
 
633 bp  230  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3385    87.61 
 
 
787 bp  210  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8099    83.53 
 
 
171 bp  117  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5571  putative transposase  89.19 
 
 
318 bp  83.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  92.98 
 
 
702 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8660    91.23 
 
 
702 bp  73.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  91.49 
 
 
702 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  91.49 
 
 
702 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  91.49 
 
 
702 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  91.49 
 
 
702 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  91.49 
 
 
702 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6139    94.59 
 
 
605 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7798  hypothetical protein  86.44 
 
 
1134 bp  54  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
1368 bp  46.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  100 
 
 
1659 bp  46.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>