13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3188 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3188    100 
 
 
249 bp  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8660    86.03 
 
 
702 bp  157  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  84.46 
 
 
702 bp  145  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6139    84.62 
 
 
605 bp  139  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  84.09 
 
 
702 bp  127  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  82.38 
 
 
702 bp  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  82.38 
 
 
702 bp  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  82.38 
 
 
702 bp  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  82.38 
 
 
702 bp  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  82.38 
 
 
702 bp  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4280    79.79 
 
 
249 bp  73.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3385    84.21 
 
 
787 bp  56  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8396    88.37 
 
 
633 bp  46.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>