11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1965 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1965    100 
 
 		 548 bp  1086    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6851    80.22 
 
 		 676 bp  200  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 972 bp  159  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8691    78.93 
 
 		 487 bp  123  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1857    78.19 
 
 		 474 bp  99.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  81.58 
 
 		 993 bp  99.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  81.14 
 
 		 825 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3946    81.6 
 
 		 314 bp  65.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  100 
 
 		 999 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0692    100 
 
 		 873 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  100 
 
 		 1032 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>