14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3221 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3221  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0205  hypothetical protein  42.46 
 
 
181 aa  157  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2967  hypothetical protein  43.48 
 
 
192 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3398  putative cytoplasmic protein  42.68 
 
 
158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0942275  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2705  hypothetical protein  42.68 
 
 
158 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4171  hypothetical protein  37.77 
 
 
196 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700055  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0054  hypothetical protein  34.07 
 
 
193 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05795  hypothetical protein  40.22 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1755  hypothetical protein  29.5 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2032  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1965  hypothetical protein  25.74 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0008  hypothetical protein  26.4 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3553  hypothetical protein  27.89 
 
 
209 aa  47.8  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0113  hypothetical protein  29.91 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>