13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1965 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1965  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2032  hypothetical protein  45.59 
 
 		 206 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0008  hypothetical protein  54.17 
 
 		 190 aa  204  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1755  hypothetical protein  36.32 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0205  hypothetical protein  31.55 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0054  hypothetical protein  33.82 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0113  hypothetical protein  27.83 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4171  hypothetical protein  29.56 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2967  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2705  hypothetical protein  28.83 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3398  putative cytoplasmic protein  28.83 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0942275  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3553  hypothetical protein  27.19 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3221  hypothetical protein  25.74 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>