19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0886 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  233  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0197396  hitchhiker  0.002894 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0566  ArsR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.562571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0443  transcriptional regulator PadR family protein  40 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1513  transcriptional regulator PadR family protein  45.68 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661269  hitchhiker  0.0000096713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0031  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.154381  hitchhiker  0.000228125 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1124  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1653  transcriptional regulator PadR family protein  37.4 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.294087  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0128  transcriptional regulator PadR family protein  38.64 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0942  hypothetical protein  34.96 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0274  regulatory protein MarR  35.63 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0105  transcriptional regulator PadR family protein  35.71 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0024  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.552032  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0425  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1499  HxlR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.353252  hitchhiker  0.00266513 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1486  regulatory protein, MarR  32 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  29.41 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0244  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  26.09 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>