39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0318 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0318  ketoisovalerate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  100 
 
 		 79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  98.73 
 
 		 95 aa  161  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.955012  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0519  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  96.2 
 
 		 85 aa  158  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  82.67 
 
 		 78 aa  127  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.22066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2173  ketoisovalerate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  75.68 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.395548 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0607  ketoisovalerate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  74.65 
 
 		 73 aa  110  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000171887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  65.71 
 
 		 627 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0951  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.54 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155581  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1983  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.3 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0686679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.91 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000175687  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1813  ferredoxin, 4Fe-4S  40.35 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4114  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  34.92 
 
 		 460 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706477  normal  0.404004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0043  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  39.68 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4176  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.09 
 
 		 755 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000648689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1862  keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit  38.71 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00222971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.76 
 
 		 759 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07910  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  38.1 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00191452  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 		 759 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1678  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.78 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0135618  normal  0.0584624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1475  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1386  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1306  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.29 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000902079  normal  0.0568667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0138  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 		 74 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.425374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1918  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2003  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0919  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  36.07 
 
 		 403 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0467  transcriptional regulator, Fis family  33.8 
 
 		 767 aa  40.8  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1960  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.5 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4766  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 1174 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.533642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3046  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  25.25 
 
 		 1190 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 355 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>