10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0112 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0112  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 334 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2540  polysaccharide deacetylase  66.57 
 
 		 331 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.152577  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1175  polysaccharide deacetylase  41.43 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0394901  normal  0.0135848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2914  hypothetical protein  26.69 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2518  hypothetical protein  28.37 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.867364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4492  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2231  hypothetical protein  26.12 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0114  hypothetical protein  27.05 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000328622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1964  hypothetical protein  30.69 
 
 		 100 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>