10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4492 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4492  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 321 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2231  hypothetical protein  36 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2914  hypothetical protein  30.03 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2518  hypothetical protein  32.78 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.867364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0112  polysaccharide deacetylase  27.94 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1175  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0394901  normal  0.0135848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2540  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.152577  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1964  hypothetical protein  34.69 
 
 		 100 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4044  hypothetical protein  24.5 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.11 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>