16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0004 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0004  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009712  MBOO_t10  tRNA-Met  94.74 
 
 		 130 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.144729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0016  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000757074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0050  tRNA-Met  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0015  tRNA-Met  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329575  decreased coverage  0.00000481165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0065  tRNA-Met  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0018    88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0063  tRNA-Met  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0018  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0028  tRNA-Met  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.822352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0043  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 98 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA14  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0026  tRNA-Met  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000286775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0016  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0027  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 112 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.446659  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0031  tRNA-OTHER  89.47 
 
 		 110 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>