8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0031 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0031  tRNA-OTHER  100 
 
 		 110 bp  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  MBOO_t10  tRNA-Met  95.56 
 
 		 130 bp  73.8  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.144729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0043  tRNA-OTHER  94.59 
 
 		 98 bp  58  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0027  tRNA-OTHER  92.31 
 
 		 112 bp  54  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.446659  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0063  tRNA-Met  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0037  tRNA-Met  93.75 
 
 		 109 bp  48.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0004  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0049  tRNA-Met  89.47 
 
 		 154 bp  44.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.984723  normal  0.477609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>