15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0029 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185002  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0058  tRNA-Arg  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.794524  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2583  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464864  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2637  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576799  hitchhiker  0.0000000000000106236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2623  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.655713  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2534  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2748  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0366523  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0048  tRNA-Arg  88.64 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0045  tRNA-Arg  88.64 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0054  tRNA-Arg  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4227  tRNA-Arg  84.13 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0074  tRNA-Arg  84.13 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.280915  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0397  tRNA-Arg  84.13 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0993004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0019  tRNA-Arg  84.13 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0041  tRNA-Arg  84.13 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>