31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0469 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0469  50S ribosomal protein L37e  100 
 
 
64 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.39506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1522  50S ribosomal protein L37e  90.62 
 
 
64 aa  121  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0495076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0397  50S ribosomal protein L37e  89.06 
 
 
64 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0438  50S ribosomal protein L37e  89.06 
 
 
64 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0291  50S ribosomal protein L37e  76.27 
 
 
62 aa  99.8  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2252  50S ribosomal protein L37e  64.29 
 
 
61 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.135184 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1813  Ribosomal protein L37e  62.5 
 
 
61 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0094  50S ribosomal protein L37e  56.36 
 
 
60 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0395  50S ribosomal protein L37e  52.73 
 
 
60 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0295683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0673  50S ribosomal protein L37e  57.69 
 
 
57 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.638312  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2140  50S ribosomal protein L37e  59.18 
 
 
52 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2925  Ribosomal protein L37e  56.86 
 
 
58 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1067  Ribosomal protein L37e  54.9 
 
 
58 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0229  50S ribosomal protein L37e  53.57 
 
 
60 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.409519  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0042  50S ribosomal protein L37e  53.06 
 
 
52 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.558285  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0039  50S ribosomal protein L37e  53.06 
 
 
52 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00771386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3060  50S ribosomal protein L37e  49.09 
 
 
60 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1082  50S ribosomal protein L37e  55.1 
 
 
52 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.247855  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0164  50S ribosomal protein L37e  54.69 
 
 
61 aa  60.8  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.11275  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2096  Ribosomal protein L37e  52.94 
 
 
57 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2045  50S ribosomal protein L37e  52.94 
 
 
58 aa  60.1  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0509029  normal  0.0973133 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0420  50S ribosomal protein L37e  49.12 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0231  50S ribosomal protein L37e  49.02 
 
 
56 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76246  predicted protein  47.69 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304139  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1390  Ribosomal protein L37e  43.64 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434822  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00700  PRCDNA38, putative  47.69 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2180  50S ribosomal protein L37e  40.74 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3499  50S ribosomal protein L37e  44.44 
 
 
56 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696455  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10196  predicted protein  43.75 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609433  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32818  Ribosomal protein L37, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  47.27 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.973212 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0220  50S ribosomal protein L37e  46.3 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>