30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0164 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0164  50S ribosomal protein L37e  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.11275  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2140  50S ribosomal protein L37e  71.74 
 
 		 52 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1082  50S ribosomal protein L37e  71.74 
 
 		 52 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.247855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0039  50S ribosomal protein L37e  69.57 
 
 		 52 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00771386 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0042  50S ribosomal protein L37e  69.57 
 
 		 52 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.558285  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1813  Ribosomal protein L37e  65.22 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0420  50S ribosomal protein L37e  66.67 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2252  50S ribosomal protein L37e  67.39 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0469  50S ribosomal protein L37e  54.69 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.39506  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0438  50S ribosomal protein L37e  53.12 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0397  50S ribosomal protein L37e  53.12 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1522  50S ribosomal protein L37e  51.56 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0495076  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0291  50S ribosomal protein L37e  55.32 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0231  50S ribosomal protein L37e  55.32 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0229  50S ribosomal protein L37e  53.19 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.409519  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0094  50S ribosomal protein L37e  51.06 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0673  50S ribosomal protein L37e  51.16 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.638312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0395  50S ribosomal protein L37e  48.94 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0295683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2180  50S ribosomal protein L37e  46.81 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3060  50S ribosomal protein L37e  45.61 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32818  Ribosomal protein L37, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  49.12 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.973212 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1390  Ribosomal protein L37e  48.08 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434822  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0220  50S ribosomal protein L37e  42.31 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3499  50S ribosomal protein L37e  42.55 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696455  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76246  predicted protein  50 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10196  predicted protein  50 
 
 		 90 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1067  Ribosomal protein L37e  47.5 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2925  Ribosomal protein L37e  47.5 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2096  Ribosomal protein L37e  47.62 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2045  50S ribosomal protein L37e  45 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0509029  normal  0.0973133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>