18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1472 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1472  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
86 aa  176  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0664  plasmid stabilization system protein  44.94 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0751  plasmid stabilization system protein  37.35 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0158403  normal  0.887347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1873  addiction module toxin, RelE/StbE  38.2 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.331501  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1880  hypothetical protein  43.28 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1850  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1021  RelE protein  37.97 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.73 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  35.71 
 
 
88 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1625  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.53 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00126224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1786  hypothetical protein  32.14 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.697447  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  32.94 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  29.41 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2094  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1045  hypothetical protein  34.52 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.114161  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  31.71 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.06 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1338  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 
86 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>