90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3154 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3154  addiction module killer protein  100 
 
 
96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429668  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1253  addiction module killer protein  67.74 
 
 
98 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2533  hypothetical protein  63.54 
 
 
96 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000474289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1221  addiction module killer protein  61.46 
 
 
96 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.958057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3175  addiction module killer protein  67.71 
 
 
100 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0569  addiction module killer protein  61.46 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.443198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0450  hypothetical protein  56.84 
 
 
98 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2823  addiction module killer protein  62.5 
 
 
98 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.299861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4469  hypothetical protein  63.16 
 
 
99 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0419  hypothetical protein  60.64 
 
 
101 aa  120  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.366932  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2008  hypothetical protein  59.14 
 
 
97 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40600  hypothetical protein  59.38 
 
 
96 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8269  addiction module killer protein  60 
 
 
101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4948  addiction module killer protein  58.33 
 
 
101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583991  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3266  addiction module killer protein  58.95 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4036  addiction module killer protein  60.67 
 
 
100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0457  hypothetical protein  55.32 
 
 
98 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0899  addiction module killer protein  56.25 
 
 
102 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4582  hypothetical protein  57.45 
 
 
112 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.213587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3781  hypothetical protein  57.45 
 
 
112 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.519742  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6940  hypothetical protein  60.22 
 
 
97 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3742  addiction module killer protein  57.45 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2313  hypothetical protein  57.45 
 
 
112 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1444  hypothetical protein  57.29 
 
 
104 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0225  hypothetical protein  54.17 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2536  hypothetical protein  53.68 
 
 
99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3081  hypothetical protein  56.25 
 
 
98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0236  addiction module killer protein  56.99 
 
 
95 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2671  hypothetical protein  55.79 
 
 
99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3673  addiction module killer protein  55.32 
 
 
105 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5508  hypothetical protein  55.32 
 
 
109 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4951  addiction module killer protein  55.32 
 
 
105 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3122  hypothetical protein  55.81 
 
 
114 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0607  addiction module killer protein  48.42 
 
 
95 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6312  addiction module killer protein  51.04 
 
 
106 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0289736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0172  addiction module killer protein  53.19 
 
 
121 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916333  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5374  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000336277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2241  addiction module killer protein  56.1 
 
 
111 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2739  hypothetical protein  56.32 
 
 
104 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1814  hypothetical protein  56.32 
 
 
104 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2689  hypothetical protein  56.32 
 
 
98 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0568  hypothetical protein  66.18 
 
 
86 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0862  hypothetical protein  52.22 
 
 
123 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622779  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2208  addiction module killer protein  47.87 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.63367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0041  addiction module killer protein  52.08 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4549  addiction module killer protein  51.69 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0855  addiction module killer protein  45.83 
 
 
97 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503668  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0501  hypothetical protein  52.33 
 
 
115 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0570  addiction module killer protein  55.81 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000000132448  unclonable  2.98787e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0367  addiction module killer protein  47.67 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.247793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4017  hypothetical protein  46.88 
 
 
104 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1687  addiction module killer protein  42.71 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05544  hypothetical protein  58.82 
 
 
75 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4221  hypothetical protein  47.73 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1302  addiction module killer protein  46.81 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0185  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2516  hypothetical protein  53.09 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.726824  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3599  hypothetical protein  50.62 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164625  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6456  addiction module killer protein  47.25 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3921  addiction module killer protein  49.38 
 
 
110 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315086  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3349  hypothetical protein  47.78 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000920139  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0050  addiction module killer protein  41.94 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0277  putative addiction module killer protein  48.1 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3001  addiction module killer protein  44.33 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5334  hypothetical protein  49.38 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3503  addiction module killer protein  49.38 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149451  hitchhiker  0.00969032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1836  hypothetical protein  43.82 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.204816  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4242  addiction module killer protein  48.81 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2958  hypothetical protein  45.68 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36110  hypothetical protein  46.34 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1183  hypothetical protein  45.68 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18062  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4138  hypothetical protein  45.68 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0172764  normal  0.111049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1307  hypothetical protein  45.35 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000276635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3745  addiction module killer protein  39.13 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117851  hitchhiker  0.00174099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4762  addiction module killer protein  46.43 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2122  addiction module killer protein  47.56 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4612  addiction module killer protein  48.81 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3988  hypothetical protein  63.27 
 
 
51 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0016  probable addiction module killer protein  38.2 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0684  hypothetical protein  47.14 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00337855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0084  hypothetical protein  39.53 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.033356  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3915  hypothetical protein  39.33 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1245  addiction module killer protein  39.33 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1427  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0167884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1331  addiction module killer protein  58.7 
 
 
48 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0428301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2734  addiction module killer protein  46.88 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1200  hypothetical protein  42.37 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000134873  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0387  prophage protein gp49  41.67 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215014  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1798  hypothetical cytosolic protein  41.67 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0173  putative addiction module killer protein  50 
 
 
42 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>