19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0173 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0173  putative addiction module killer protein  100 
 
 		 42 aa  80.5  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0899  addiction module killer protein  55.56 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0419  hypothetical protein  62.5 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.366932  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2533  hypothetical protein  65.71 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000474289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1221  addiction module killer protein  65.71 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.958057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40600  hypothetical protein  68.97 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0185  hypothetical protein  53.66 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431442  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6940  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4469  hypothetical protein  56.25 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1253  addiction module killer protein  61.76 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0862  hypothetical protein  51.28 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622779  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2823  addiction module killer protein  58.33 
 
 		 98 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.299861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3154  addiction module killer protein  50 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1444  hypothetical protein  55.56 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2516  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.726824  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4036  addiction module killer protein  54.55 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3122  hypothetical protein  58.62 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3988  hypothetical protein  52.78 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3599  hypothetical protein  53.33 
 
 		 110 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>