10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0565 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0565  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00786663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1338  hypothetical protein  34.62 
 
 
234 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.962556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1416  hypothetical protein  30 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0921  hypothetical protein  29.74 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3902  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.912333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8542  hypothetical protein  26.67 
 
 
445 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0020593  hitchhiker  0.0000124506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3772  hypothetical protein  25.23 
 
 
435 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00313382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3067  hypothetical protein  25 
 
 
425 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0803146  normal  0.450185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3918  hypothetical protein  23.97 
 
 
409 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.870645  normal  0.346395 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00360  hypothetical protein  32.31 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>