32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3668 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3668  ferredoxin  100 
 
 		 33 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.025462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  81.82 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.150596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1890  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  68.75 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1702  ferredoxin  63.64 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2104  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  66.67 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  63.64 
 
 		 258 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3185  Iron-sulfur cluster-binding protein  70 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000998162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.5 
 
 		 269 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 241 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000282709  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  57.58 
 
 		 240 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00390588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 293 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  57.58 
 
 		 242 aa  42.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2040  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.12 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1980  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.25 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0902  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 314 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.533273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1492  iron-sulfur cluster-binding protein  53.12 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00658416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.12 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0181618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60 
 
 		 273 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.25 
 
 		 271 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60 
 
 		 273 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0504  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.25 
 
 		 285 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4082  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  60 
 
 		 269 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3448  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.84 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.61 
 
 		 277 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232825  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0339  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.67 
 
 		 265 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.101668  normal  0.562339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3247  iron-sulfur cluster-binding protein  63.33 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08160  4Fe-4S protein  54.84 
 
 		 322 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.127337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  63.33 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000371436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2642  iron-sulfur cluster-binding protein  60 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.317648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>