42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3354 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3354  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139206  normal  0.137393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2156  hypothetical protein  81.36 
 
 
59 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1496  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.279239  hitchhiker  0.000413072 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3485  hypothetical protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1498  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29415  hitchhiker  0.000395653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1586  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1692  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186807  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1934  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2087  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2160  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.639372  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2363  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000393238  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2651  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2667  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2708  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal  0.80509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2915  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000386305  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3235  hypothetical protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0294411  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3265  hypothetical protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3289  hypothetical protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3354  hypothetical protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3358  hypothetical protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730892  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3401  hypothetical protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0858405  normal  0.124182 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3413  hypothetical protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0628007  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1388  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0007  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000467317  normal  0.127483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0020  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0124  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0398  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0797  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0838  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0906  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444725  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0960  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1174  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1227  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00131975  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1347  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18568  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1465  transposase IS4 family protein  56 
 
 
343 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0478  transposase, IS4  46 
 
 
328 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.616853  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3123  transposase, IS4  44 
 
 
328 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  unclonable  0.0000172155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2313  transposase, IS4  44 
 
 
328 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2138  transposase, IS4  44 
 
 
328 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.390955  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1522  transposase, IS4  44 
 
 
328 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1855  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00672548  normal  0.0405478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0240  transposase, IS4  42 
 
 
328 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.192612  normal  0.536679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>