13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3082 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3082  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  352  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.749144  normal  0.114182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2188  protein of unknown function DUF567  49.67 
 
 
152 aa  156  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0295349  hitchhiker  0.000955512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0313  protein of unknown function DUF567  39.26 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.123057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3074  hypothetical protein  67.5 
 
 
94 aa  112  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.48123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3075  hypothetical protein  63.08 
 
 
66 aa  84.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0680  hypothetical protein  28.39 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5272  hypothetical protein  27.81 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0809  hypothetical protein  25.66 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00206882  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0110  hypothetical protein  25.48 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000332628  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07460  hypothetical protein  29.91 
 
 
193 aa  51.2  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.192157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1292  hypothetical protein  26.35 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1218  hypothetical protein  26.47 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.392035  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47746  predicted protein  24.42 
 
 
271 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.649636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>