19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2235 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2235  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  825    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  28.81 
 
 
603 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  34.19 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1831  acyltransferase 3  29.09 
 
 
331 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  28.35 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  27.71 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  28.36 
 
 
353 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  23.03 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  24.49 
 
 
338 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  31.58 
 
 
362 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.21 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  36.89 
 
 
368 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  27.94 
 
 
598 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  26.02 
 
 
354 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  29.36 
 
 
378 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  24.71 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  26.7 
 
 
605 aa  44.3  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  33.88 
 
 
362 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  29.77 
 
 
640 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>