30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2052 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2052  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2528  protein of unknown function LppY and LpqO  37.59 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3649  hypothetical protein  41.95 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2102  protein of unknown function LppY and LpqO  37.83 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0435208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1894  protein of unknown function LppY and LpqO  35.2 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4739  protein of unknown function LppY and LpqO  34.56 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10615  lipoprotein lpqO  38.52 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000327081  normal  0.345127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1870  protein of unknown function LppY and LpqO  39.63 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3442  protein of unknown function LppY and LpqO  35.97 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6160  protein of unknown function LppY and LpqO  34.46 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4247  protein of unknown function LppY and LpqO  35.14 
 
 		 337 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.508847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2235  protein of unknown function LppY and LpqO  34.01 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7991  protein of unknown function LppY and LpqO  34.01 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13014  lipoprotein lppY  34.67 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0283362  normal  0.369301 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5143  protein of unknown function LppY and LpqO  29.55 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6195  hypothetical protein  28.96 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000214863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2825  protein of unknown function LppY and LpqO  30.65 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0063  hypothetical protein  34.11 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1560  LpqO-like protein  34.47 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0080  hypothetical protein  34.47 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2464  hypothetical protein  30.7 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2101  hypothetical protein  29.55 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3155  hypothetical protein  33.8 
 
 		 139 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0651385  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0144  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2939  protein of unknown function LppY and LpqO  31.93 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3254  hypothetical protein  29.75 
 
 		 131 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.488535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3217  putative cytoplasmic protein  29.03 
 
 		 128 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3243  hypothetical protein  29.03 
 
 		 131 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0680421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2102  hypothetical protein  40 
 
 		 55 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2640  hypothetical protein  32.39 
 
 		 138 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>