28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1870 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1870  protein of unknown function LppY and LpqO  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3649  hypothetical protein  75.09 
 
 		 303 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2528  protein of unknown function LppY and LpqO  56.54 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2102  protein of unknown function LppY and LpqO  55.48 
 
 		 294 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0435208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4739  protein of unknown function LppY and LpqO  55.25 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1894  protein of unknown function LppY and LpqO  54.28 
 
 		 319 aa  298  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6160  protein of unknown function LppY and LpqO  53.38 
 
 		 309 aa  291  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2235  protein of unknown function LppY and LpqO  51.27 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7991  protein of unknown function LppY and LpqO  50.96 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10615  lipoprotein lpqO  51.97 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000327081  normal  0.345127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3442  protein of unknown function LppY and LpqO  53.48 
 
 		 295 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4247  protein of unknown function LppY and LpqO  43.07 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.508847  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13014  lipoprotein lppY  40.29 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0283362  normal  0.369301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2052  hypothetical protein  39.63 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5143  protein of unknown function LppY and LpqO  35.86 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2825  protein of unknown function LppY and LpqO  38.55 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0063  hypothetical protein  34.52 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6195  hypothetical protein  33.22 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000214863 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0080  hypothetical protein  34.57 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594301  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1560  LpqO-like protein  34.57 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2464  hypothetical protein  31.95 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2101  hypothetical protein  30.67 
 
 		 192 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0144  hypothetical protein  39.39 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2102  hypothetical protein  36.59 
 
 		 55 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3155  hypothetical protein  23.81 
 
 		 139 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0651385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2939  protein of unknown function LppY and LpqO  26.09 
 
 		 128 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3243  hypothetical protein  20.16 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0680421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2640  hypothetical protein  21.49 
 
 		 138 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>