20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3954 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3954  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 37 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  97.3 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  97.3 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  75.68 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  75.68 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  75.68 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  72.97 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  72.97 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  72.97 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  70.27 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  62.16 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  62.16 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  62.16 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  67.57 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  67.57 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  56.76 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3443  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6662  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00105508  hitchhiker  0.00193087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0233  hypothetical protein  54.55 
 
 		 41 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>