24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1531 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1531  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.977478  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1630  hypothetical protein  66 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13840  hypothetical protein  63.83 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0889  hypothetical protein  52.86 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93552e-23 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3739  hypothetical protein  56 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1360  hypothetical protein  45.59 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218176  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06061  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.693871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1373  hypothetical protein  44.93 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1664  hypothetical protein  41.1 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21910  hypothetical protein  45.28 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0753  hypothetical protein  50.77 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3608  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0279579  normal  0.399105 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0929  hypothetical protein  42.03 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3356  hypothetical protein  51.92 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000427569  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1491  hypothetical protein  55.26 
 
 		 46 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3535  hypothetical protein  48.89 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.907357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3504  hypothetical protein  45.71 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1532  hypothetical protein  35.82 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1082  hypothetical protein  49.06 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  36.62 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  39.71 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1390  hypothetical protein  46.67 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0155  hypothetical protein  38.24 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000254633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0251  hypothetical protein  35.21 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837242  hitchhiker  0.00453428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>