22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_13840  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  131  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1630  hypothetical protein  54.41 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3739  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1373  hypothetical protein  48.53 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3608  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0279579  normal  0.399105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1531  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.977478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0251  hypothetical protein  33.82 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837242  hitchhiker  0.00453428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2776  hypothetical protein  44.93 
 
 
69 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3535  hypothetical protein  51.22 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.907357  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  43.48 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06061  hypothetical protein  37.31 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.693871 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1491  hypothetical protein  57.89 
 
 
46 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0753  hypothetical protein  33.8 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  40.58 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1532  hypothetical protein  48.89 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1360  hypothetical protein  37.31 
 
 
74 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1650  hypothetical protein  37.25 
 
 
70 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000012075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0889  hypothetical protein  30.88 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93552e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1390  hypothetical protein  43.9 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192663  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1175  hypothetical protein  53.85 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1176  hypothetical protein  45.61 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0929  hypothetical protein  35.21 
 
 
74 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>