32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1532 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1532  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0821  hypothetical protein  44.93 
 
 
80 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0176075  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0719  hypothetical protein  44.93 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2086  hypothetical protein  52.78 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000270884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0889  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93552e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0753  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2776  hypothetical protein  38.46 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3608  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0279579  normal  0.399105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3739  hypothetical protein  41.86 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1082  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  34.78 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1390  hypothetical protein  41.86 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1373  hypothetical protein  32.35 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1630  hypothetical protein  44.19 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3535  hypothetical protein  34.78 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.907357  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0155  hypothetical protein  31.43 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000254633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3504  hypothetical protein  38.46 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21910  hypothetical protein  41.51 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1630  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3356  hypothetical protein  41.54 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000427569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  35.71 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13840  hypothetical protein  48.89 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3560  hypothetical protein  41.03 
 
 
79 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0161833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1175  hypothetical protein  43.59 
 
 
63 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0930  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.864226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2678  hypothetical protein  51.16 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1650  hypothetical protein  34 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000012075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0929  hypothetical protein  36.51 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1664  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0251  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837242  hitchhiker  0.00453428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2081  hypothetical protein  66.67 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1031  hypothetical protein  59.26 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.288931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>