More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00363 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00363  Transposase and inactivated derivative  100 
 
 
111 aa  232  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01415  Transposase and inactivated derivative  93.69 
 
 
111 aa  221  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01284  Transposase and inactivated derivative  93.69 
 
 
111 aa  221  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000849512  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3977  IS66 Orf2 family protein  48.6 
 
 
114 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  45.92 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  44.86 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1295  IS66 Orf2 family protein  56.52 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  40.91 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  40.91 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  40.91 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0366  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  39.45 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  42.99 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  41.82 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0274  IS66 Orf2 family protein  40.37 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  41.82 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0282  IS66 Orf2 family protein  40.37 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  41.82 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  39.81 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  41.82 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  41.82 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  41.82 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0227  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  42.99 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  42.99 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  40 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  37.27 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  39.45 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  39.42 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  39.42 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  38.53 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1583  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4275  ISSfl4 ORF2  40 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.935918  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  35.45 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0037  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0161  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0106398  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0432  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0435  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.566567  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1049  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0743171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1164  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0832363  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1549  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.555012  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1989  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.228694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3085  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325367  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3637  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4115  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  43.69 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>