19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6090 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6090  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  875    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3117  hypothetical protein  27.39 
 
 
477 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1124  hypothetical protein  27.41 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.447668  normal  0.160467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4912  hypothetical protein  27.65 
 
 
488 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3697  hypothetical protein  27.17 
 
 
488 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334318  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2523  putative transmembrane protein  29.57 
 
 
522 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118866  normal  0.0110425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4536  hypothetical protein  27.17 
 
 
488 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414416  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3827  hypothetical protein  27.17 
 
 
488 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0911  hypothetical protein  27.36 
 
 
491 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413579  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2616  hypothetical protein  27.36 
 
 
491 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2478  hypothetical protein  27.02 
 
 
491 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394399  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5553  hypothetical protein  26.7 
 
 
488 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0842  hypothetical protein  28.18 
 
 
498 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2269  hypothetical protein  26.7 
 
 
488 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0550  hypothetical protein  27.02 
 
 
491 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430271  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3730  hypothetical protein  26.7 
 
 
488 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2239  putative transmembrane protein  26.77 
 
 
497 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0139148  normal  0.185349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1064  putative transmembrane protein  27.85 
 
 
486 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1962  putative transmembrane protein  26.55 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>