20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4536 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0911  hypothetical protein  79.71 
 
 
491 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1962  putative transmembrane protein  72.07 
 
 
493 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1064  putative transmembrane protein  69.77 
 
 
486 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3730  hypothetical protein  93.03 
 
 
488 aa  923    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3697  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  977    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334318  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4912  hypothetical protein  91.6 
 
 
488 aa  906    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2478  hypothetical protein  79.71 
 
 
491 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2616  hypothetical protein  79.71 
 
 
491 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3827  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  977    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5553  hypothetical protein  93.24 
 
 
488 aa  926    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4536  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2239  putative transmembrane protein  72.28 
 
 
497 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0139148  normal  0.185349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0550  hypothetical protein  79.18 
 
 
491 aa  775    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2269  hypothetical protein  94.88 
 
 
488 aa  941    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2523  putative transmembrane protein  42.32 
 
 
522 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118866  normal  0.0110425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3117  hypothetical protein  32.11 
 
 
477 aa  257  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1124  hypothetical protein  31.26 
 
 
475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.447668  normal  0.160467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6090  hypothetical protein  26.14 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0842  hypothetical protein  24.52 
 
 
498 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0168  hypothetical protein  26.01 
 
 
494 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>