20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1758 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1758  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  353  5.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0941  BS_ykrK family protein  33.33 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.253763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1318  hypothetical protein  39.25 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19200  protein of unknown function (DUF1836)  33.03 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0398564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1942  hypothetical protein  33.04 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.318368  normal  0.0759806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3211  hypothetical protein  36.25 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000281051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1353  hypothetical protein  28.42 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.723305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5638  hypothetical protein  35.23 
 
 
186 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5576  hypothetical protein  35.23 
 
 
186 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5702  hypothetical protein  36.05 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5591  hypothetical protein  35.23 
 
 
186 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5246  hypothetical protein  35.23 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5371  hypothetical protein  35.23 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.414011  hitchhiker  0.000233389 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5547  hypothetical protein  36.05 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423726 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5148  hypothetical protein  33.7 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0726043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5133  hypothetical protein  36.05 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000775312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5306  hypothetical protein  36.05 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1724  hypothetical protein  30.34 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0569422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0574  hypothetical protein  30.1 
 
 
196 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1452  hypothetical protein  27.03 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00758898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>