21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0306 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0306  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000907216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0354  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235186 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2407  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00372571  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1423  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.4 
 
 		 58 aa  47.4  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0267  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.73 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0300363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  45.65 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 60 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>