73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0515 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0515  cell division protein FtsL  100 
 
 
102 aa  197  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3677  cell division protein FtsL  53.54 
 
 
100 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.67489  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2987  cell division protein FtsL  58.14 
 
 
100 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0455  putative cell division ftsL transmembrane protein  56.63 
 
 
101 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.706499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0814  cell division protein FtsL  58.06 
 
 
109 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  0.80895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4563  cell division protein FtsL  52.94 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3424  cell division protein FtsL  50.98 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494139  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0912  cell division protein FtsL  62.69 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1068  cell division protein, FtsL -like  56.58 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175772  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1463  cell division protein FtsL  50.62 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3432  cell division protein, FtsL -like  48.28 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2731  cell division protein FtsL  40.59 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2851  cell division FtsL transmembrane protein  41.67 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3096  cell division protein FtsL  41.67 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2680  cell division protein FtsL  34.74 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0479  putative cell division transmembrane protein, FtsL  32.46 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3477  cell division protein FtsL  33.01 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000038193  hitchhiker  0.00939757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2843  cell division protein FtsL  32.08 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3505  cell division protein, FtsL -like  41.1 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.120335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0523  cell division protein FtsL  32.41 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0070  cell division protein, FtsL -like  32.41 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0552  cell division protein FtsL  32.41 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0456  cell division protein FtsL  32.18 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3638  cell division protein, FtsL -like  32.29 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0481  cell division protein FtsL  32.18 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916571  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2986  cell division protein, FtsL -like  38.82 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2276  cell division protein, FtsL -like protein  29.76 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.373522 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2558  cell division protein FtsL, putative  33.64 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3225  cell division protein FtsL  33.64 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3557  cell division protein FtsL  33.64 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1338  cell division protein FtsL  33.64 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0479  cell division protein FtsL  33.64 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3552  cell division protein FtsL  33.64 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3532  cell division protein FtsL  31.76 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.969446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1111  cell division protein FtsL, putative  31.76 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2501  cell division protein, FtsL-like  38.75 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.773445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3787  cell division protein FtsL  41.77 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3599  cell division protein FtsL  40.51 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0762  cell division protein FtsL  33.75 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0754  cell division protein FtsL  39.24 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0603  cell division protein FtsL  41.77 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1330  cell division protein FtsL  37.84 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60348  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4394  cell division protein FtsL  37.84 
 
 
97 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105943  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4415  cell division protein FtsL, putative  35.14 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3135  cell division protein, FtsL -like protein  35.06 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293158  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4109  cell division protein FtsL  33.78 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0334939  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0133  cell division protein FtsL  35.37 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000273113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0137  cell division protein FtsL  35.37 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0085  cell division protein FtsL  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.811512  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0138  cell division protein FtsL  35.37 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0130  cell division protein FtsL  35.37 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0091  cell division protein FtsL  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3434  cell division protein FtsL  33.33 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0641  cell division protein FtsL  39.24 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00083  hypothetical protein  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0076  cell division protein FtsL  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3517  cell division protein FtsL  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0089  cell division protein FtsL  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00084  membrane bound cell division protein at septum containing leucine zipper motif  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3574  cell division protein FtsL  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507772  hitchhiker  0.000631421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0088  cell division protein FtsL  36.25 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.660147  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0937  cell division protein FtsL  37.5 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0133  cell division protein FtsL  35.37 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4519  cell division protein FtsL  36.49 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13180  cell division protein FtsL  39.47 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4680  cell division protein, FtsL-like  31.65 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0487302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3525  cell division protein FtsL  36.59 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.100792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2925  cell division protein FtsL  36.59 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3394  cell division protein FtsL  36.59 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2200  cell division protein FtsL  39.39 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.469837  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03265  cell division protein FtsL  32.39 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0114313  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2054  cell division protein  40 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.81614  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1975  cell division protein FtsL  40 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>