39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23290 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23290  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1784  hypothetical protein  67.05 
 
 		 95 aa  120  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3874  hypothetical protein  73.33 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2124  hypothetical protein  71.59 
 
 		 95 aa  116  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6235  hypothetical protein  62.5 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4114  hypothetical protein  64.77 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1346  hypothetical protein  56.82 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.093057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5022  hypothetical protein  67.78 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1959  hypothetical protein  62.07 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.655649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4100  hypothetical protein  73.03 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1500  Protein of unknown function DUF2277  62.79 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2423  hypothetical protein  56.82 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5849  hypothetical protein  57.95 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.449702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0012  hypothetical protein  57.95 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000302425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1979  Protein of unknown function DUF2277  70.79 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367079  normal  0.383603 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6437  hypothetical protein  57.95 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.175327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3228  hypothetical protein  69.32 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0790385  hitchhiker  0.00000720157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2050  hypothetical protein  65.17 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0782  hypothetical protein  69.32 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1521  hypothetical protein  64.77 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3637  Protein of unknown function DUF2277  71.59 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1700  hypothetical protein  57.33 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00489273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1936  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2833  hypothetical protein  53.49 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1627  hypothetical protein  55.13 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0246366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0703  hypothetical protein  63.64 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.394732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3498  Protein of unknown function DUF2277  59.15 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12900  hypothetical protein  52.38 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1910  Protein of unknown function DUF2277  47.73 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1878  hypothetical protein  47.06 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9020  hypothetical protein  63.08 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12843  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3867  Protein of unknown function DUF2277  51.14 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3607  hypothetical protein  56.16 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1986  hypothetical protein  47.62 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.664421  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0873  hypothetical protein  56.25 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2089  hypothetical protein  51.19 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2135  hypothetical protein  51.19 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0178676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2072  hypothetical protein  51.19 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00877589  normal  0.392124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>